香港浸会大学中医药学院开设的中医学硕士学位课程目的在于提高学员在中医药理论、临床及研究等各方面的专业能力。课程设计充分考虑香港的实际需要，通过中医药科目及专科的教学及专题研究，使学员能既博又专，在理论、临床及至科研等专业范畴得到全面提升。课程设置3个专业方向：中医内科研究与应用丶针灸研究与应用丶骨伤与推拿研究与应用。共通科目为所有学生而设，专业方向分化科目为修读该专业方向学生而设。